FISL15 – DIYbio hackeando o software da vida

03 Apr 2014

Confirmada para dia 10/05/2014, 16:00hrs no salão 41F (250 lugares).

Quer hackear seu DNA ou sua própria vida ?

DIYbio é uma rede de indivíduos globais que querem hackear a biologia aplicando práticas de “Faça você mesmo”.

Objetivo da palestra é demonstrar as principais as iniciativas e ideias para modelagem de sistemas biológicos via computação. Ensinaremos como trabalhar com dados do seu próprio DNA.

Demonstração de projetos como Wholecell da Universidade Stanford.

Neste momento, em algum lugar dos Estados Unidos, da Inglaterra ou até da Índia, algum biólogo sintético amador está realizando um experimento na sua cozinha ou garagem. Nos últimos dois anos, entusiastas da biologia molecular têm se juntado para montar organizações de biologia sintética amadora, como o DIYbio (do-it-yourself biology), em que os membros se reúnem em pubs e barbecues para discutir os últimos experimentos realizados nas suas próprias garagens. Há quase seis meses tenho participado das discussões desse grupo, que apresentam conteúdo refinado e objetivo sobre o desenvolvimento de microscópios de 10 dólares, espectrofotômetros, centrífugas de furadeiras ou liquidificadores, construções de diferentes kits com E. coli modificada, chegando até a sequenciadores de DNA caseiros.

Fonte: http://synbiobrasil.org/2011/02/15/do-it-yourself-biologists-dyibio-e-a-ciencia-cidada/

Tópicos:

DIYbio foi fundado em 2008 no EUA com missão de criar uma comunidade de biologos com intuito de “Faça você mesmo”. A principal missão é acreditar que biotecnologia e mostrar para o grande público o grande potencial de benefícios (http://diybio.org/).

Comentários sobre o livro BioPunk: DIY Scientists hack the software of life.

Opensource para processamento de DNA.

Simulando uma célula com projeto Wholecell.

Entender uma cultura de bacterias e como simula-la no computador.

Processamento do GENOMA por U$ 1.000,00.

Install virt-v2v on Debian from source

02 Apr 2014

Howto install virt-v2v from source code on Debian or Ubuntu.

git clone https://git.fedorahosted.org/git/virt-v2v.git

sudo apt-get install dh-autoreconf

sudo apt-get install libguestfs-tools

sudo apt-get install libxml-dom-perl libxml-xpath-perl libxml-dom-xpath-perl \ 
libterm-progressbar-perl libdatetime-perl libnet-server-perl \ 
libnet-https-any-perl libnet-https-nb-perl libnet-httpserver-perl \
libcrypt-ssleay-perl

wget http://launchpadlibrarian.net/85191944/libdigest-sha1-perl_2.13-2build2_amd64.deb

sudo dpkg -i libdigest-sha1-perl_2.13-2build2_amd64.deb

./run v2v/virt-v2v.pl